I semi della Copiapoa hypogaea hanno caratteristico aspetto a virgola, sono neri e lucidi.
Seminati freschi lo stesso giorno di altre semine sono stati gli ultimi a germogliare. Ma poi sono germinati tutti in tempi differenti, alcuni dopo un mese.
I frutti hanno una quantità di polpa media, che è bene rimuovere prima della semina.
Essendo una pianta autofertile produce semi da sola, per aumentarne la quantità smuovo il polline con uno stecchino ogni giorno di apertura del fiore.
I frutti si spaccano da soli quando i semi sono pronti, ma non lasciano cadere i semi che rimangono appiccicati grazie ai residui di polpa.
La Copiapoa hypogaea var. barquitensis ha fiorito a fine luglio e poi a fine agosto, dopo un mese dalla fioritura il frutto si apre mostrando i semi.
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